希望大家帮忙给个意见

我之前是在江西的一家公司上班，我工作的地点是江西九江。但我这家公司的总部是在南昌，由于跟公司有些劳动纠纷需要向劳动局申请劳动仲裁，可是劳动局告诉我如果九江这家公司没有在工商局注册的话就必须去南昌去申请劳动仲裁，我是九江人，这样太麻烦了且来回跑会有很高的费用，如果我在南昌申请劳动仲裁胜诉的话可以要求该公司补偿我的这些费用呢，希望大家能给我点意见谢谢。