他却以我单位无故拖欠工资为名申请了仲裁，不知我怎样能不输官司

您好我是一家单位，我想咨询一下，我的一员工违反了公司的规章制度，让我失去了客户．我刚要惩罚他，他却以我单位无故拖欠工资为名申请了仲裁，不知我怎样能不输官司？从三月至十一月他领了三次工资，他的工资按合同约定为每月５３０元（当地最低基本工资），我曾告诉过他他需要钱就管我要（我已让我的其他员工写了书面证明），他所领的三次工资合计为２４００，其余工资及补助，我告诉过他年底发，这个公司规章制度里有，还有在他签定合同后我曾开会宣读过；他没管我要我也就没给他发工资，我不知道这算不算无故拖欠工资？他提出辞职，我不给他办辞职手续可不可以？他犯错误我扣掉他当月工资可不可以？