使用Python将mat文件转换为npy文件

本人最近在做心电信号的处理，有时候会用到npy文件，但官方给的数据库中并没有npy文件，只有dat、ecg、st、hea文件，于是，我先先去PhysioBank ATM将心电信号数据导出为mat格式文件，通过如下语句便可以将mat转换为npy。

注意：只有mat文件里全都是数据时才可直接通过np.save转为npy格式，如果mat文件里不仅仅是数据，还包括一些非数据的内容，比如标签之类的，则比如先将mat文件里的数据提取完后才能进行转换。

以我处理的心电信号为例来说，它是一个字典类型dict，里面包括一些属性，通过相应的语句可以看出它里面包含的属性有：'__header__', '__version__', '__globals__', 'val'这四个，我刚开始对于这四个属性并不了解，不清楚各个里面存了什么内容，将各个属性打印后，发现val里面存的是数据，因此，我将val里面数据提出来，便可以将其转为npy文件。

导入数据：

data=sio.loadmat('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66m.mat')

如果mat里全都是数值，则可以通过如下语句转为npy

np.save('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66npy.npy',data)

如果mat里包含非数值型数据：

查看文件包含的属性：

print(list(data))

 打印各个属性包含的内容：

print(data["val"])

 提取包含数值的那个属性

data2=data['val'];

导出npy

np.save('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66npy.npy',data2)

 完整代码如下

case1：mat只包含数值文件：

import numpy as np
import scipy.io as sio
data=sio.loadmat('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66m.mat')
np.save('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66npy.npy',data) 

case2：mat包含非数值：

import numpy as np
import scipy.io as sio

data=sio.loadmat('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66m.mat')

#以下为我调试的内容，查看哪个属性下包含数值文件
print(type(data)) #显示mat的数据类型
print(list(data)) #只显示mat包含的属性
print(data["val"]) #显示属性值#
#找到数值型的属性后，转为npy
data2=data['val'];
np.save('G:MIT_BPDmit-bih-polysomnographic-database-1.0.0slp66npy.npy',data2)

PhysioBank ATMhttps://archive.physionet.org/cgi-bin/atm/ATM