conda的安装
使用wget命令下载anaconda或miniconda 推荐下载miniconda
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
给执行权限并运行
chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
禁止环境变量
Do you wish the installer to initialize Miniconda3
by running conda init? [yes|no]
[no]
切换到miniconda3/bin, 启动 conda
chmod 777 activate
source ./activate
添加清华源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
显示已安装的频道
conda config --set show_channel_urls yes
查看已安装的频道
vim ~/.condarc
conda的使用
conda下载软件包
conda install xxx
搜索软件包
conda search xxx
查看该软件安装的位置
which xxx
安装特定版本的软件包
conda install 软件名 版本号
conda install pytorch 1.7.1
查看已安装软件
conda list
更新指定软件
conda update xxx
卸载指定软件
conda remove gatk
退出conda环境
../deactivate
conda deactivate
conda环境创建
conda create -n xxx python x.x
删除环境
conda remove -n xxx --all
重命名环境
conda create -n 新名字 --clone 旧名字
conda remove -n 旧名字 --all
