甘肃农业大学研究生教育始于1953年，是我国高校中首批硕士学位授予单位，第二批博士学位授予单位，第一批农业推广和兽医硕士专业学位授权单位，第二批在职人员以研究生毕业同等学历申请硕士学位单位。现有1个国家级重点学科、1个农业部重点学科和12个省级重点学科;3个博士后科研流动站，6个一级学科博士、硕士学位授权点，22个二级学科博士学位授权点，8个一级学科硕士学位授权点，62个二级学科硕士学位授权点。拥有兽医博士专业学位授权和农业推广硕士、兽医硕士、工程硕士等3类硕士专业学位授权。学位授权学科涉及农学、理学、工学、经济学、管理学等5个学科门类，初步形成了多渠道、多规格、多层次的研究生培养模式。
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学校现有博士研究生指导教师108人，硕士研究生指导教师450人。在学全日制研究生1705人，其中博士研究生377人;非全日制研究生1016人。建校60多年来,甘肃农业大学已为西北地区及全国培养了数百名博士研究生和数千名硕士研究生，为国家经济和社会发展做出了重要贡献。
甘肃农业大学研究生管理机构最早是1953年成立的研究生指导委员会，后历经多次演变，1995年9月成立了研究生处。目前，研究生处设有学位与学科建设办公室(副处级建制)、招生办公室、培养科、管理科等四个科室。现有工作人员12人。 一九九九年十一月，甘肃农业大学研究生处被教育部、国务院学位委员会授予“全国学位与研究生教育管理工作先进集体”称号。二0一一年被评为甘肃省“十一五”学位与研究生教育管理先进集体。
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