目前开设环境科学与工程专业的院校很多，有综合性大学、科技大学、工业大学，也有地矿石油农业大学。清华大学、北京大学、哈尔滨工业大学、同济大学、北京师范大学、南京大学、浙江大学、中国农业大学等院校。不同的学校侧重不同的领域和发展，但也会有交叉合作。
1997年，清华大学在原有给水排水科学与工程专业的基础上，设立了中国第一个环境科学与工程专业，成为中国环境工程专业起步的标志。
哈工大环境工程专业起源于1950年成立的卫生工程专业，是全国最早培养水处理高级专门人才的基地之一。哈工大环境学科是国内唯一拥有国家重点实验室、国家工程研究中心、国家工程实验室、国家创新研究群体、国际创新引智基地、国家国际合作基地、国家教学模拟实验室等重大平台的学科。
同济大学环境科学与工程学院下设三个系:市政工程系、环境工程系、环境科学系。有市政工程(给水排水工程)、环境工程、环境科学三个二级学科专业，其中环境工程为国家重点学科、上海市重点学科，市政工程为国家重点学科。
北京大学也是国内最早开展环境科学教学和研究的院校之一。环境科学有大气环境、环境管理和可持续发展三个主要方向，形成了大气环境化学和大气环境模拟与控制两个学科方向。
北京师范大学环境学院设有环境科学系、环境管理系、环境生态工程系和环境系统工程系四个系，环境科学和环境工程两个本科专业。环境化学学院在环境化学和环境规划与评价两个方向上特色明显。主要从事水环境过程与效应、水生态过程与效应、城市生态模拟与调控、湿地生态模拟与调控、流域环境修复与生态修复等领域的基础理论与应用研究。
南京大学环境学院也是国内最早开展环境科学研究的单位之一。它有三个系:环境科学，环境工程和环境规划与管理。环境方向在有毒有机废水研究和农药、染料、医药、化学品等资源化利用方面特色明显。
目前，中国农业大学资源与环境学院拥有4个一级学科。本科招生以环境科学与工程为主，包括资源与环境科学、应用气象学、生态学、环境工程四个专业。农业与环境是国家“双一流”重点建设学科，生态学是北京市重点学科。
需要注意的是，农业资源环境与环境工程专业不招收色盲或色弱的考生。《高等学校招生体检工作指导意见》还规定，肺、肝、肾、脾、胃肠道等主要器官接受过大手术，功能恢复良好，或患有心肌炎、胃或十二指肠溃疡、慢性支气管炎、风湿性关节炎等病史，甲亢治愈满一年；任何矫正到4.8镜片、屈光度大于800度的眼睛；如果一只眼失明，另一只眼矫正到度数大于400度的4.8镜片，则不适宜学习环境科学、环境生态学等专业。
当然，这不是一个硬性规定。考生报考时应仔细阅读《高等学校招生章程》中的具体要求。
