电算化审计与传统手工审计的区别有：
1、审计线索不同。会计电算化的资料不再是传统的凭证等文字记录和资料，而是磁盘和磁带，肉眼所见的线索减少，很难用人工实现各种总账与分账之间的相互换算。
2、审计内容不同。会计电算化信息系统大大减少了计算或过账错误，但会计电算化系统可能被舞弊程序或者黑客利用，且不容易察觉，有比较大的系统安全性问题。
3、技术方法不同。电子计算机不能逐笔打印记录供工作人员阅读，一般过一个阶段打印一次，并且平时只能凭借机器阅读，很难做到在多笔记录中对照查看。
4、技术手段不同。会计电算化信息系统审计人员由手工操作向电子计算机转变，把电子计算机当作一种提高审计质量和效率的有利工具来使用。
