财经法纪审计的流程包括：
1、立案阶段。立案时，审计机关应根据当时的实际情况，以当时的法律、政策作为衡量标准来考虑是否需要立案。立案依据的来源不同，立案的手续也有所不同。
2、查证阶段。也叫取证阶段，这是开展财经法纪审计的关键阶段，是财经法纪审计中极为重要的一环，工作的关键在于搜集和整理真实有效、确凿可靠、有充分证明力的审计证据。
3、定案阶段。定案阶段是财经法纪审计的终结阶段，分为结案与处理两个过程。结案时要计量相应的经济损失、论定案件的性质、落实具体责任、并撰写审计报告书。审计报告经上级批准后，审计机关要作出审计结论和审计决定，对严重违反财经法纪的行为进行处理，并交有关部门执行。
