分析性审计程序在审计实务中的运用有：
1、在风险评估阶段的具体运用。在风险评估阶段，利用分析性审计程序的目的是帮注册会计师发现财务报表中的异常变化，或与其发生而未发生的变化识别潜在的重大错报风险领域，通过对被审计单位重大错报风险的评估帮助注册会计师设计进步审计程序的性质、时间和范围，提高审计效率和效果。
2、在实质性程序中的具体运用。实质性分析程序与细节性测试都可以用于收集审计证据，以此来识别财务报表认定层次的重大错报风险。
3、在总体复核阶段的具体运用。在审计完成阶段，注册会计师需要通过执行分析程序对财务报表进行整体符合，以此来判断审计结论是否恰当以及财务报表的整体是否公允。
