注册会计师内部控制是被审计单位为了合理保证财务报告的可靠性、经营的效率和效果以及对法律法规的遵守，由治理层，管理层和其他人员设计与执行的政策及程序。
内部控制的目标有财务报告的可靠性、经营的效果和效率、遵守适用的法律法规要求；内控五要素分别是控制环境、风险评估过程、与财务报告相关的信息系统和沟通、控制活动以及对控制的监督。
与审计相关的内部控制并非均与财务报告相关，与财务报告相关的内部控制并非均与审计相关；注册会计师需要了解和评价的是与审计相关的内部控制，并非被审计单位所有的内部控制；被审计单位与目标相关，但与审计无关的控制，注册会计师无须加以考虑。
