注册会计师独立性分为实质上的独立性和形式上的独立性。实质上的独立性是指注册会计师在发表意见时不受影响，保持公正、客观和专业怀疑；形式上的独立性要求注册会计师在第三方面前其身份必须是独立于委托单位的，与被审查企业或个人没有任何特殊的利益关系，如不得拥有被审查企业股权或承担其高级职务，不能是企业的主要贷款人，资产受托人或与管理当局有亲属关系等。
实质上的独立性是无形的，难以测量的；形式上的独立性是有形的，可以观察的。注册会计师在执行审计业务时，要同时保持实质和形式的独立性。实质上的独立只有当注册会计师在整个审计过程中保持真正中立，即在执业过程中严格保持超然性，不主观偏袒任何一方当事人时才成立，而形式上的独立则关系到社会公众对注册会计师独立性评判的结果。
