1、银行汇票主要用于异地结算，而银行本票只用于同城；
2、付款行不一样，银行汇票的付款行通常是本系统或他系统的异地他行，而本票是谁开谁付；
3、开票原因不一样，银行汇票是汇款人先将钱存入银行，银行只是帮助其“汇款”。属于中间业务，而本票是银行对收款人或持票人的负债。
银行汇票与银行承兑汇票有着本质的不同。银行汇票是银行开的，而银行承兑汇票是企业开的，只是为了增强汇票的信用而申请其开户银行对其承兑。银行汇票付款是银行，而银行承兑汇票的付款人是企业，只有企业账上余额不足时，银行才代为付款，但银行仍然对该企业有追索权，通常企业开的商业汇票都需要银行承兑（即银行承兑汇票）。市场上的商业承兑汇票较少。
