通常情况下，自由职业缴纳的公积金和在公司缴纳的公积金在福利待遇上是差不多的，没有什么太大的不同的，但是在缴纳时还是有所不同的，下面来具体介绍一下。第一点差别是：个人自主缴存公积金只在某些地区是允许的，许多地区住房公积金管理中心还没出具个人自主缴存公积金政策；而单位缴存公积金具有普适性。第二点差别是：单位缴存公积金是职工和单位是各自按照一定比例缴存的住房储金，缴存基数指的是职工上一年度（自然年度）月平均工资，职工个人缴存的住房公积金以及单位为其缴存的住房公积金，实行专户存储，归职工个人所有；而个人自主缴存公积金要按照一定比例缴存。第三点差别是：个人自主缴存公积金的时候必须要自己去缴存地住房公积金管理中心缴纳；而单位缴存公积金会有公司专门的经办人去公司当地住房公积金管理中心缴纳。
