合作医疗报销比例按照3类来进行区分:门诊报销、住院报销、大病报销。1、门诊报销：凡是在居住的村卫生室及村中心卫生室就诊，报销医疗费用60%，患者就诊处方药费限额10元，如需在卫生院输液，可在医生临时补液进行补贴，限额50元。前往镇卫生院就诊报销医疗费用40%，同时可报销各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。二级医院就诊报销30%，同时可报销就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。前往三级医院就诊报销20%，可报销就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。中药发票附上处方每贴限额1元，每年镇级合作医疗门诊可进行补偿最多5000元。2、住院报销：在镇卫生院住院，可报销60%；在二级医院住院，可报销40%；在三级医院住院，可报销30%。3、大病报销：参加合作医疗的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即费用在5001-10000元补偿65%，费用在10001-18000元补偿70%。在镇级合作医疗住院或者进行尿毒症血透、在肿瘤门诊进行放疗和化疗补偿年限额1.1万元。
