(1)A公司应当在2007年7月1日之前提出行政复议申请。根据《行政复议法》的规定,当事人认为具体行政行为侵犯其合法权益的,可以自知道该具体行政行为之日起60日内提出行政复议申请。(2)A公司还可以向丙县人民政府提出行政复议申请。根据《行政复议法》的规定,对县级以上人民政府工作部门的具体行政行为不服的,申请人既可以向该部门的本级人民政府申请行致复议,也可以向上一级主管部门申请行政复议。(3)A公司还可以向人民法院提起行政诉讼。

(1)A公司应当在2007年7月1日之前提出行政复议申请。根据《行政复议法》的规定,当事人认为具体行政行为侵犯其合法权益的,可以自知道该具体行政行为之日起60日内提出行政复议申请。(2)A公司还可以向丙县人民政府提出行政复议申请。根据《行政复议法》的规定,对县级以上人民政府工作部门的具体行政行为不服的,申请人既可以向该部门的本级人民政府申请行致复议,也可以向上一级主管部门申请行政复议。(3)A公司还可以向人民法院提起行政诉讼。