08界毕业生就业协议问题!

08年3月签到一家国有企业,用的是就业协议,一式三份的那种!7月份学校发毕业证,等我回去领的时候学校已经把毕业证和档案寄到单位了!由于种种原因我不想在这干了,去人事部他们说要交3000块违约金,不交的话毕业证和档案就被扣了!协议书上写了拿不到毕业证视为违约,也没写不签合同要交违约金!请问他们这样合法吗?我现在该怎么办?