就业协议规定劳动期限

我是08年应届毕业生（还没有正式毕业），我与公司签订了就业协议，公司在备注中规定了工作期限是到2010年6月31日，如果违约就赔偿一万元。我估计会在今年7月份与公司签订劳动合同。我想问一下，与公司签订劳动合同后，就业协议中规定的违约金是否继续有效，如果签订合同后违约就得按就业协议中写的赔偿一万元吗？？谢谢