将三金作为工资发给我们合法吗

我于2003年3月开始在一家公司工作，在刚进入公司时与公司签定了劳动合同，合同规定了我的工资金额为2400元，并规定公司将为我办理交纳三金，但是公司一直没有帮我们办理交纳三金的事情。直到2003年10月，公司遭到原来工作的员工的投诉，此员工进行了劳动仲裁，公司败诉，为此员工办理了交纳三金的事情。公司为了防止类似的问题再次出现，又以原来合同补充条款的形式，让我们重新签定了合同，合同规定，三金我们自愿选择自己交纳，公司将此部分以工资的形式发给我们，并将原来的工资金额由2400元改为1544元。同时为了配合这个规定，公司重新制作了工资表，将原来的工资构成变为1544元，其他部分改为三金形式，但工资总金额不变。 现在我已经离开此家公司，由于公司一直没有给我们办理交纳三金，所以我想申请劳动仲裁，但是由于曾经签定了变更的合同，公司说愿意帮我们交纳三金，但是三金已经以工资的形式支付给我们，所以如果要交纳，我们必须将此部分工资退给公司。 请问公司的这一说法正确吗？