scanpy赋值注意点

python中赋值都是引用形式的，不要随便改动赋值后值的值，会影响原来变量的取值

import scanpy as sc 
import numpy as np 

aa=np.array([[1,2,3],[2,3,3],[3,2,1]])
adata=sc.AnnData(aa)
print(adata.X)
bb=adata.X
print(bb)
bb[1]=[100,200,300]## 千万不要乱赋值，否则会修改原来的值
print(bb)
print(adata.X)

结果如下

可以看到adata.X里面的值会自动修改，如果不想修改，就使用copy()

import scanpy as sc 
import numpy as np 

aa=np.array([[1,2,3],[2,3,3],[3,2,1]])
adata=sc.AnnData(aa)
print(adata.X)
bb=adata.X.copy()
print(bb)
bb[1]=[100,200,300]
print(bb)
print(adata.X)

结果如下

但是，这里需要注意的一点是，这种赋值对adata.raw是不起作用的

import scanpy as sc 
import numpy as np 

aa=np.array([[1,2,3],[2,3,3],[3,2,1]])
adata=sc.AnnData(aa)
adata.raw=adata  ## 但是需要注意的是
sc.pp.scale(adata)
print(adata.X)
print("========")
print(adata.raw.X)

结果如下

可以看到，这里的adata.raw.X并没有因为adata.X的改变而改变