在创建的python环境下进行
conda activate test_py3
安装
conda install crossmap
检查是否可以使用
CrossMap.py -h
下载chain文件
https://pythonhosted.org/CrossMap/
示例
CrossMap.py bigwig hg38ToHg19.over.chain.gz GSM4950768_KYSE30_2_4.normalized.bigWig KYSE30_2_4_hg38.bigwig #基本格式 python CrossMap.py [文件格式] [chain文件] input output
参考链接:
https://zhuanlan.zhihu.com/p/45731354
https://pythonhosted.org/CrossMap/



