栏目分类:
子分类:
返回
名师互学网用户登录
快速导航关闭
当前搜索
当前分类
子分类
实用工具
热门搜索
名师互学网 > IT > 软件开发 > 后端开发 > Go语言

R语言:转录组GO柱状图

Go语言 更新时间: 发布时间: IT归档 最新发布 模块sitemap 名妆网 法律咨询 聚返吧 英语巴士网 伯小乐 网商动力

R语言:转录组GO柱状图

在转录组学分析中,识别差异基因后,根据差异基因进一步注释到其富集的通路对深入挖掘差异基因的生物学信息具有重要的意义。差异基因比对不同的数据库富集到不同类型通路,其中重要的是KEGG与Gene_Ontology两个数据库,在上一篇中我们分享可制作kegg气泡图的教程。今天和大家分享的是GO条形图的R语言实现

#设置工作目录,注意R语言识别的路径与传统意义上的电脑储存路径写法不一致,直接“属性”复制的时候需要注意转换“”成“/”。

setwd("E:/....../GO_class/GO_class")

#加载R包

library(ggplot2)

#加载并查看数据

GO<-read.delim(choose.files(),header= TRUE,check.names=F)

head(GO)

#调整顺序

GO$type_order=factor(rev(as.integer(rownames(GO))),labels=rev(GO$GO_classify2))

#绘图(纵向)

ggplot(data=GO,aes(x=GO$type_order,y=

转载请注明:文章转载自 www.mshxw.com
本文地址:https://www.mshxw.com/it/903104.html
我们一直用心在做
关于我们 文章归档 网站地图 联系我们

版权所有 (c)2021-2022 MSHXW.COM

ICP备案号:晋ICP备2021003244-6号