linux使用ftp命令批量传fastaq文件（scidb/生信/0基础）

1.

往science data bank （scidb）上传数据的时候对方给出ftp地址如下

地址: ftp://ftp.scidb.cn:2121
账号: ******
密码: ******

[D:~]$ ping ftp.scidb.cn

正在 Ping ftp.scidb.cn [60.245.194.36] 具有 32 字节的数据:
请求超时。

60.245.194.36 的 Ping 统计信息:
    数据包: 已发送 = 1，已接收 = 0，丢失 = 1 (100% 丢失)，
^C

2.

上传数据有2个文件夹，一共100个fastaq文件（.fq.gz），软链到一个文件夹下

(base) Thu May 12 21:06:57 /data3/user/transport_data/ (6)
$mkdir trans
(base) Thu May 12 21:07:03 /data3/user/transport_data/ (7)
$cd trans/
(base) Thu May 12 21:07:05 /data3/user/transport_data/trans/ (0)
$ls
(base)Thu May 12 21:07:05 /data3/user/transport_data/trans/ (0)
$ln -s ../16.tissue/
aspera.openssh   b38_1.fq.gz      b47_1.fq.gz.md5  b50_2.fq.gz      b55_2.fq.gz.md5  b59_1.fq.gz      fq/
b35_1.fq.gz      b38_1.fq.gz.md5  b47_2.fq.gz      b50_2.fq.gz.md5  b57_1.fq.gz      b59_1.fq.gz.md5  GSA.bash.sh
b35_1.fq.gz.md5  b38_2.fq.gz      b47_2.fq.gz.md5  b53_1.fq.gz      b57_1.fq.gz.md5  b59_2.fq.gz      list
b35_2.fq.gz      b38_2.fq.gz.md5  b48_1.fq.gz      b53_1.fq.gz.md5  b57_2.fq.gz      b59_2.fq.gz.md5  NCBI.bash.sh
b35_2.fq.gz.md5  b44_1.fq.gz      b48_1.fq.gz.md5  b53_2.fq.gz      b57_2.fq.gz.md5  b60_1.fq.gz
b36_1.fq.gz      b44_1.fq.gz.md5  b48_2.fq.gz      b53_2.fq.gz.md5  b58_1.fq.gz      b60_1.fq.gz.md5
b36_1.fq.gz.md5  b44_2.fq.gz      b48_2.fq.gz.md5  b55_1.fq.gz      b58_1.fq.gz.md5  b60_2.fq.gz
b36_2.fq.gz      b44_2.fq.gz.md5  b50_1.fq.gz      b55_1.fq.gz.md5  b58_2.fq.gz      b60_2.fq.gz.md5
b36_2.fq.gz.md5  b47_1.fq.gz      b50_1.fq.gz.md5  b55_2.fq.gz      b58_2.fq.gz.md5  bash.sh
(base) hu May 12 21:07:05 /data3/user/transport_data/trans/ (0)
$ln -s ../16.tissue/*.fq.gz .
(base)Thu May 12 21:07:17 /data3/user/transport_data/trans/ (26)
$ls
b35_1.fq.gz@  b38_1.fq.gz@  b47_1.fq.gz@  b50_1.fq.gz@  b55_1.fq.gz@  b58_1.fq.gz@  b60_1.fq.gz@
b35_2.fq.gz@  b38_2.fq.gz@  b47_2.fq.gz@  b50_2.fq.gz@  b55_2.fq.gz@  b58_2.fq.gz@  b60_2.fq.gz@
b36_1.fq.gz@  b44_1.fq.gz@  b48_1.fq.gz@  b53_1.fq.gz@  b57_1.fq.gz@  b59_1.fq.gz@
b36_2.fq.gz@  b44_2.fq.gz@  b48_2.fq.gz@  b53_2.fq.gz@  b57_2.fq.gz@  b59_2.fq.gz@
(base) Thu May 12 21:07:19 /data3/user/transport_data/trans/ (26)
$ln -s ../other/*.fq.gz .
(base)Thu May 12 21:07:28 /data3/user/transport_data/trans/ (100)
$ls
10_1.fq.gz@   27_1.fq.gz@  42_1.fq.gz@  59_1.fq.gz@  68_1.fq.gz@  76_1.fq.gz@  99_1.fq.gz@   b48_1.fq.gz@  b59_1.fq.gz@
102_1.fq.gz@  27_2.fq.gz@  42_2.fq.gz@  59_2.fq.gz@  68_2.fq.gz@  76_2.fq.gz@  99_2.fq.gz@   b48_2.fq.gz@  b59_2.fq.gz@
102_2.fq.gz@  28_1.fq.gz@  47_1.fq.gz@  60_1.fq.gz@  70_1.fq.gz@  87_1.fq.gz@  b35_1.fq.gz@  b50_1.fq.gz@  b60_1.fq.gz@
10_2.fq.gz@   28_2.fq.gz@  47_2.fq.gz@  60_2.fq.gz@  70_2.fq.gz@  87_2.fq.gz@  b35_2.fq.gz@  b50_2.fq.gz@  b60_2.fq.gz@
15_1.fq.gz@   31_1.fq.gz@  49_1.fq.gz@  6_1.fq.gz@   72_1.fq.gz@  89_1.fq.gz@  b36_1.fq.gz@  b53_1.fq.gz@
15_2.fq.gz@   31_2.fq.gz@  49_2.fq.gz@  6_2.fq.gz@   72_2.fq.gz@  89_2.fq.gz@  b36_2.fq.gz@  b53_2.fq.gz@
18_1.fq.gz@   34_1.fq.gz@  5_1.fq.gz@   63_1.fq.gz@  73_1.fq.gz@  91_1.fq.gz@  b38_1.fq.gz@  b55_1.fq.gz@
18_2.fq.gz@   34_2.fq.gz@  5_2.fq.gz@   63_2.fq.gz@  73_2.fq.gz@  91_2.fq.gz@  b38_2.fq.gz@  b55_2.fq.gz@
25_1.fq.gz@   38_1.fq.gz@  56_1.fq.gz@  64_1.fq.gz@  74_1.fq.gz@  93_1.fq.gz@  b44_1.fq.gz@  b57_1.fq.gz@
25_2.fq.gz@   38_2.fq.gz@  56_2.fq.gz@  64_2.fq.gz@  74_2.fq.gz@  93_2.fq.gz@  b44_2.fq.gz@  b57_2.fq.gz@
26_1.fq.gz@   40_1.fq.gz@  57_1.fq.gz@  65_1.fq.gz@  75_1.fq.gz@  98_1.fq.gz@  b47_1.fq.gz@  b58_1.fq.gz@
26_2.fq.gz@   40_2.fq.gz@  57_2.fq.gz@  65_2.fq.gz@  75_2.fq.gz@  98_2.fq.gz@  b47_2.fq.gz@  b58_2.fq.gz@

3.

 ftp
 open 60.245.194.36 2121
 #输用户名：ftpuser
 #输密码：password
ftp>lcd ***  #切到上传文件绝对路径
ftp>!ls     #查看上传文件目录下的文件
ftp>hash    #显示#表示下载进度
ftp>prom    #打开批量上传或下载的开关，不然不能进行批量操作！！
ftp>mput  *.fq.gz   #使用当前文件传送类型将本地文件复制到远程计算机上,模糊匹配


##ftp>mput  -o ./123/ *.fq.gz  #上传到ftp服务器的指定目录

​​​​参考1https://blog.csdn.net/guokeliunian/article/details/51086314#:~:text=linux%20ftp%E6%89%B9%E9%87%8F%E4%B8%8A%E4%BC%A0%E5%92%8C%E4%B8%8B%E8%BD%BD%E6%96%87%E4%BB%B6%20%E4%B8%80%E3%80%81%E7%99%BB%E5%BD%95ftp,%23ftp%23open%20192.168.1.111%2023%23%E7%94%A8%E6%88%B7%E5%90%8D%EF%BC%9Aftpuser%23%E5%AF%86%E7%A0%81%EF%BC%9Apassword%20%E4%BA%8C%E3%80%81%E5%9C%A8ftp%E4%B8%8A%E5%88%87%E6%8D%A2%E6%9C%AC%E5%9C%B0%E7%9B%AE%E5%BD%95

参考2 这个贼啦全 大神在民间https://blog.csdn.net/guokeliunian/article/details/51086314#:~:text=linux%20ftp%E6%89%B9%E9%87%8F%E4%B8%8A%E4%BC%A0%E5%92%8C%E4%B8%8B%E8%BD%BD%E6%96%87%E4%BB%B6%20%E4%B8%80%E3%80%81%E7%99%BB%E5%BD%95ftp,%23ftp%23open%20192.168.1.111%2023%23%E7%94%A8%E6%88%B7%E5%90%8D%EF%BC%9Aftpuser%23%E5%AF%86%E7%A0%81%EF%BC%9Apassword%20%E4%BA%8C%E3%80%81%E5%9C%A8ftp%E4%B8%8A%E5%88%87%E6%8D%A2%E6%9C%AC%E5%9C%B0%E7%9B%AE%E5%BD%95