下面三种格式提供参考
data <- read_excel("C:/XXX/1.xlsx", sheet = "Sheet1", col_names = TRUE)
data <- read.table(file = 'manifest.tsv', sep = 't', header = TRUE)
data <- read.csv('胃癌和癌前数据.csv')
【2】看下这三种读取的格式条件选择,自己符合哪一种
查看当前目录文件 list.files(pattern = "\.tsv") # tsv格式的数据文件 list.files(pattern = "^C") # 以C开头的文件 list.files(pattern = ".tsv$") # 以.tsv结尾的文件【3】循环读取文件
我自己处理宏基因组的结果报告,是以为report.tsv结尾的文件,当然还有error.tsv的文件
#循环读取正式
lf <-list.files(pattern = "report.tsv$") #以report.tsv 结尾的
files <- gsub("\.tsv", "", lf) #切掉后缀.tsv,获得这些名称,为循环准备
files
for (i in seq_along(files))
assign(files[i], read.table(lf[i], sep = 't', header = TRUE))



