使用Python编程,输入为隐形眼镜数据集,计算所有可能的特征的信息增益,选择最优的特征值划分数据集,进而递归地构建决策树。其中为了更加直观地呈现决策树,使用Matplotlib编程将决策树可视化。最后,根据训练好的决策树执行分类,预测患者需要佩戴的隐性眼镜类型。
实验时长: 60分钟
主要步骤:
使用Python选择最优特征递归构建决策树
决策树的可视化
使用决策树执行分类预测
2、实验环境
Anaconda 4.3.30
Python 3.6.6
Numpy 1.13.1
Matplotlib 2.2.2
scikit-learn 0.18.2
graphviz 2.30.1
3、相关技能
Python编程
Matplotlib编程
决策树构建
决策树可视化
4、相关知识点
决策树的原理
决策树(decision
tree)是一种基本的分类与回归方法,是一个预测模型,他代表的是对象属性与对象值之间的一种映射关系。决策树可以看作一个if-then规则的集合:由决策树的根结点到叶结点的每一条路径构建一条规则;路径上内部结点的特征对应着规则的条件,而叶结点的类对应着规则的结论。
使用决策树预测需要以下过程:收集数据、准备整理数据、分析数据、训练算法构造决策树、测试算法、使用算法。
决策树的构建
特征选择:特征选择在于选取对训练数据具有分类能力的特征,决定用哪个特征来划分特征空间,可以提高决策树学习的效率。通常特征选择的标准是信息增益或信息增益比。信息增益指的是划分数据集之后信息发生的变化,通过经验熵和条件熵,计算每个特征值划分数据集获得的信息增益,获得信息增益最高的特征就是最好的选择。特征A对训练数据集D的信息增益g(D,A),定义为集合D的经验熵H(D)与特征A给定条件下D的经验条件熵H(D|A)之差,即:g(D,A)=H(D)-
H(D|A)。
决策树的生成和修剪:使用C4.5、ID3、CART等算法,基于最好的属性值划分数据集,递归地构建决策树,直到不能继续下去为止。但这样产生的树往往对训练数据的分类很准确,但对未知的测试数据的分类却没有那么准确,即出现过拟合现象。针对这一问题,考虑决策树的复杂度,对已生成的决策树进行修剪简化。
决策树可视化
通过Python编程构建的决策树不够清晰直观,可以使用强大的Matplotlib绘制决策树。可视化需要用到的函数:
getNumLeafs——获取决策树叶子结点的数目
getTreeDepth——获取决策树的层数
plotNode——绘制结点
plotMidText——标注有向边属性值
plotTree——绘制决策树
createPlot——创建绘制面板
使用决策树分类预测
依靠原始数据集构造好的决策树,可以对实际数据进行分类预测。执行数据分类时,需要决策树以及用于构造树的标签向量。然后,程序比较测试数据与决策树上的数值,递归执行该过程直到进入叶子结点,最后将测试数据定义为叶子结点所属的类型,完成对数据的预测。
5、实现效果隐性眼镜分类问题决策树可视化结果如下图:
6.1进入/home/zkpk/pycharm-2017.3.5/bin目录,切换到root用户,输入密码(zkpk)
[zkpk@localhost tgz]$ cd ~/pycharm-2017.3.5/bin [zkpk@localhost bin]$ su root
修改hosts文件,在/etc/hosts文件末添加一行0.0.0.0
account.jetbrains.com,注意account前面有一个空格(按I键,添加以下内容后按Esc键,输入:wq,再按Enter键即可保存退出)。修改完成后使用exit命令退出root权限。
[root@localhost bin]# vi /etc/hosts 0.0.0.0 account.jetbrains.com
在/home/zkpk/pycharm-2017.3.5/bin目录下,使用./pycharm.sh命令打开Pycharm,点击create
new project创建工程DecisionTree,在工程下创建sklearn_dctree.py并设置Python
Interpreter。
6.2复制home/zkpk/experiment/experiment3文件下的隐性眼镜数据lenses.txt到工程目录下。隐形眼镜数据的四个特征分别为:
age(年龄)、prescript(症状)、astigmatic(是否散光)、tearRate(眼泪数量) 。隐形眼镜类别有三类(最后一列):硬材质(hard)、软材质(soft)、不适合佩戴隐形眼镜(no
lenses) 。
6.3本实验需用到绘图工具Graphviz。已预先安装在实验环境上,检查安装配置是否成功,打开terminal,输入
dot –version,显示如下配置成功:
1
6.4重启Pycharm编辑器,打开sklearn_dctree.py文件,import相关model
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder, oneHotEncoder from sklearn.externals.six import StringIO from sklearn import tree import pandas as pd import numpy as np import pydotplus
6.5读入隐性眼镜数据。得到lenses 和lenses_target列表:
with open('lenses.txt', 'r') as fr: #加载文件
lenses = [inst.strip().split('t') for inst in fr.readlines()] #处理文件
lenses_target = [] #提取每组数据的类别,保存在列表里
for each in lenses:
lenses_target.append(each[-1])
6.6处理数据,读特征标签,建立lenses_dict字典,key为每个标签名,值为lenses数据在该标签上的取值。再将字典转为pandas
Dataframe格式,方便后续处理。
lensesLabels = ['age', 'prescript', 'astigmatic', 'tearRate'] #特征标签
lenses_list = [] #保存lenses数据的临时列表
lenses_dict = {} #保存lenses数据的字典,用于生成pandas
for each_label in lensesLabels: #提取信息,生成字典
for each in lenses:
lenses_list.append(each[lensesLabels.index(each_label)])
lenses_dict[each_label] = lenses_list
lenses_list = []
# print(lenses_dict) #打印字典信息
lenses_pd = pd.Dataframe(lenses_dict)
le = LabelEncoder() #创建LabelEncoder()对象,用于序列化
for col in lenses_pd.columns: #序列化
lenses_pd[col] = le.fit_transform(lenses_pd[col])
6.7创建决策树,将处理好的数据训练决策树。
clf = tree.DecisionTreeClassifier(max_depth = 4) #创建DecisionTreeClassifier()类 clf = clf.fit(lenses_pd.values.tolist(), lenses_target)
6.8用graphviz绘制决策树,并保存决策树为pdf格式。
dot_data = StringIO()
tree.export_graphviz(clf, out_file = dot_data, #绘制决策树
feature_names = lenses_pd.keys(),
class_names = clf.classes_,
filled=True, rounded=True,
special_characters=True)
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
graph.write_pdf("tree.pdf")
6.9运行程序。点击右键,选择‘run sklearn_dctree’。
6.10结果隐性眼镜分类问题决策树可视化结果如下图:
代码清单DecisionTree.sklearn_dctree.py:
代码清单DecisionTree.sklearn_dctree.py:
完成本实验可掌握决策树的构造,如何计算信息熵,选择最优数据集特征,并使用sklearn创造决策树并绘制保存决策树。



