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ubuntu用gdc-client从TCGA上下载数据的步骤

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ubuntu用gdc-client从TCGA上下载数据的步骤

1.下载

1. GDC Data Transfer Tool | NCI Genomic Data Commons

下载gdc-client到 Downloads

 

 

2.在Downloads下打开终端

输入: unzip gdc-client_v1.6.0_Ubuntu_x64-py3.7_0.zip

解压gdc-client,直接解压到Downloads

3.在Downloads下打开终端后输入 ./gdc-client -h 可以看到

 

4.输入 ./gdc-client download -m gdc_*****.txt

下载manifest中包含的切片

表示成功下载了一个

指定输出文件夹,可以输入

./gdc-client download -m gdc_manifest.txt  -d out_directory

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