本人的代码是基于python的，java的可参考底部链接。
1、创建Root窗口（即桌面窗口）会话
# 配置Root窗口
desired_caps = {'app': 'Root', 'deviceName': 'windowsPC', 'platformName': 'windows'}
# 创建Root窗口会话
driver = webdriver.Remote(command_executor='http://127.0.0.1:4723', desired_capabilities=desired_caps)
2、在Root窗口会话中枚举你想要测试的程序窗口的句柄（可根据窗口名称枚举）
# 在Root窗口中根据 测试窗口的名称，获取句柄
main_win = self.driver.find_element(AppiumBy.NAME, "软件中心 - NW.js")
# 注意，句柄需要转为16进制
hd = hex(int(main_win.get_attribute("NativeWindowHandle")))
3、根据窗口句柄创建新会话
# 使用取到的句柄，配置测试窗口
caps = {"appTopLevelWindow": str(hd)}
# 建立测试窗口的会话
driver2 = webdriver.Remote(command_executor='http://127.0.0.1:4723', desired_capabilities=caps)
4、操作你的测试窗口吧（比如点击测试窗口的升级按钮）
driver2.find_element_by_name("升级").click()
参考链接：
GitHub - microsoft/WinAppDriver at v1.0https://github.com/Microsoft/WinAppDriver/tree/v1.0#creating-a-desktop-session
