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快速插值定期采样的3D数据,其中x,y和z的间隔不同

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快速插值定期采样的3D数据,其中x,y和z的间隔不同

您可以使用

map_coordinates
一点代数。比方说您的网格间距是
dx
dy
dz
。我们需要将这些 现实世界 坐标映射到
数组索引 坐标,因此让我们定义三个新变量:

xx = x / dxyy = y / dyzz = z / dz

输入到的 数组索引

map_coordinates
是一个形状数组,
(d, ...)
其中
d
是原始数据的维数。如果定义一个数组,例如:

scaling = np.array([dx, dy, dz])

您可以通过一点广播魔术除以将 现实世界的 坐标转换为 数组索引 坐标

scaling

idx = coords / scaling[(slice(None),) + (None,)*(coords.ndim-1)]

举个例子:

dx, dy, dz = 1, 1, 2scaling = np.array([dx, dy, dz])data = np.random.rand(10, 15, 5)

假设我们要沿平面插值

2*y - z = 0
。我们取两个垂直于平面法线向量的向量:

u = np.array([1, 0 ,0])v = np.array([0, 1, 2])

并获得我们要插入的坐标为:

coords = (u[:, None, None] * np.linspace(0, 9, 10)[None, :, None] +          v[:, None, None] * np.linspace(0, 2.5, 10)[None, None, :])

我们使用以下命令将它们转换为 数组索引 坐标并进行内部转换

map_coordinates

idx = coords / scaling[(slice(None),) + (None,)*(coords.ndim-1)]new_data = ndi.map_coordinates(data, idx)

最后一个数组具有形状

(10, 10)
,并且在位置
[u_idx, v_idx]
上具有与坐标对应的值
coords[:, u_idx, v_idx]

您可以在此想法的基础上,通过在缩放之前添加偏移量来处理坐标不以零开始的插值。



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