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在pandas中将列追加到HDF文件的框架

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在pandas中将列追加到HDF文件的框架

完整的文档在这里,一些食谱策略在这里

PyTables是面向行的,因此您只能追加行。逐段阅读csv,然后在整个过程中附加整个框架,如下所示:

store = pd.HDFStore('file.h5',mode='w')for chunk in read_csv('file.csv',chunksize=50000):         store.append('df',chunk)store.close()

您必须要小心一点,因为在逐块读取时,结果框架的dtypes可能具有不同的dtypes,例如,您有一个像column这样的整数,直到第二个chunkchunk之前都没有缺失值。第一个块的该列为

int64
,第二个块的为
float64
。您可能需要使用
dtype
关键字to强制dtypes
read_csv
,请参见此处。

这也是一个类似的问题。



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