如果我没记错的话，您链接到的“ ffmpeg包装器”项目已过时并且不会维护。ffmpeg是一个非常活跃的项目，经常进行很多更改并发布。
您应该查看Xuggler项目，该项目提供了您想要执行的操作的Java API，并且它们与ffmpeg紧密集成。
http://www.xuggle.com/xuggler/
如果您选择沿着Runtime.exec（）路径运行，则此Red5线程应该很有用：
http://www.nabble.com/java-call-ffmpeg-
ts15886850.html
