为什么即使Android Studio在代码中未显示错误，库模块中的程序包在编译时也不存在？

更改此行。

compile project('libs:AndEngine')

在

compile project(':app:libs:AndEngine')

无论如何，将库模块放在app模块内部不是一个好主意。我建议您使用以下结构：

root  settings.gradle  app    build.gradle  libs    AndEngine      build.gradle

然后在你的

settings.gradle

include ':libs:AndEngine'include ':app'

在你的

app/build.gradle

compile project(':libs:AndEngine')