您将获得服务器返回的内容-与Web浏览器相同。然后，Web浏览器将运行脚本。HTML Agility Pack仅是HTML解析器-
它无法解释javascript或将其绑定到文档的内部表示形式。如果要运行脚本，则需要Web浏览器。完整的“无头”网络浏览器将是您问题的完美答案。那是结合了HTML解析器，javascript解释器和模拟浏览器DOM的模型的所有东西，它们一起工作。基本上，这是一个Web浏览器，除了没有呈现部分。目前，还没有一种东西可以完全在.NET环境下工作。
最好的选择是使用
WebBrowser控件，并在程序控制下在Internet
Explorer中实际加载和运行页面。这不会很快或很漂亮，但是它将满足您的需要。
另请参见我对类似问题的回答：使用.Net加载DOM并在服务器端执行javascript，其中讨论了.NET中执行此操作的可用技术。不幸的是，大多数组件现在都存在，但还不存在或没有以正确的方式集成。
