您应该将它们放在类路径中，例如
java -classpath someJar.jar YourMainClass
而且，当然，您可以对javac执行相同的操作。
如果您的类路径上需要有多个jar或目录，则需要使用平台的默认路径分隔符。例如，在Windows上，
java -classpath someJar.jar;myJar.jar YourMainClass
附带一提，您可能会发现使用IDE来管理这种事情比较容易。我个人只使用了略带脚本的编辑器，并且运行良好。但是很高兴知道如何通过命令行执行此操作。
