首先你需要有一个linux的环境，回头我会上传一个linux系统的虚拟机
其次在linux系统下用浏览器打开trimmomatic的下载链接，下载最新版本对应的binary下载链接http://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimmomatichttp://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimmomatic下载完成后，将其解压到一个新的文件夹中，然后复制trimmomatic-0.39.jar的路径，打开终端，输入jar <路径>/trimmomatic-0.39.jar，注意这个最后的版本号要改成你下载的版本哦
例如：jar /home/sai/workspace/go/src/project/Trimmomatic-0.39/trimmomatic-0.39.jar
即可运行。什么？你的终端里报出了下面的代码？
程序 'jar' 已包含在下列软件包中: * default-jre * gcj-4.9-jre-headless * gcj-5-jre-headless * openjdk-8-jre-headless * gcj-4.8-jre-headless * openjdk-9-jre-headless 请尝试：sudo apt install <选定的软件包>
不用慌，按照提示直接输入 sudo apt install default-jre，回车，输入y，回车，等它安装完之后，再输入sudo apt install default-jdk（注意这次最后是jdk结尾），回车，输入y，回车。等安装完之后，就可以运行trimmomatic了。
