栏目分类:
子分类:
返回
名师互学网用户登录
快速导航关闭
当前搜索
当前分类
子分类
实用工具
热门搜索
名师互学网 > IT > 软件开发 > 后端开发 > Python

品种特异位点,利用样本vcf参照打分

Python 更新时间: 发布时间: IT归档 最新发布 模块sitemap 名妆网 法律咨询 聚返吧 英语巴士网 伯小乐 网商动力

品种特异位点,利用样本vcf参照打分

import pandas as pd
df = pd.read_csv("labuladuo_loci.txt")
quanshe = pd.read_table("北京犬舍.vcf")
 
loci_list = quanshe['ID'].values.tolist()
vareity_list = quanshe.columns.tolist()
score = {}
for variety in variety_list:
     score[variety] = 0
quanshe.set_index(["ID"], inplace=True)
df.set_index(["ID"], inplace=True)
vareity_list.pop(2)
for locus in loci_list:
    for variety in vareity_list:
        if(quanshe.loc[locus,variety]==df.loc[locus,"ID"]):
            score[variety] = score[variety] + 1

转载请注明:文章转载自 www.mshxw.com
本文地址:https://www.mshxw.com/it/444346.html
我们一直用心在做
关于我们 文章归档 网站地图 联系我们

版权所有 (c)2021-2022 MSHXW.COM

ICP备案号:晋ICP备2021003244-6号