您是正确的，跨进程的同步将无法使用Java同步结构进行。幸运的是，您的问题确实不是代码同步之一，而是同步与数据库的交互。
解决此问题的正确方法是使用数据库级锁定。大概您有一个包含数据库模式版本的表，因此您应确保在启动/升级过程中锁定该表。
如果您指定数据库类型（DB2？）和访问方法（原始sql，jpa等），则涉及的精确sql / db调用可能会更加清楚。
更新（8/4/2009 2:39 PM）
：我建议在一些保存模式版本的表上使用LOCK
TABLE语句。这将序列化对该表的访问，从而防止两个实例一次通过升级代码运行。
