1.在Win10pro安装Docker,参考Docker在Win10中的安装及相关配置
2.组织好待整理的数据:
-project -Dicom -sub-01 -T1 -Func -sub-02 -...
2.打开Linux终端:打开Windows Powershell,输入bash运行
3.获取HeuDiConv镜像:docker pull nipy/heudiconv:latest
4.运行:
docker run --rm -it -v /mnt/c/UsersDesktop/project:/base nipy/heudiconv:latest -d /base/Dicom/sub-{subject}Desktop/project改为自己的项目路径,使用-v将该路径映射到/bash
/base/Dicom/sub-{subject}Desktop/project:/base nipy/heudiconv:latest -d /base/Dicom/{subject}/*/* -o /base/Nifti/ -f /base/Nifti/code/heuristic.py -s $sub -c dcm2niix -b --overwrite
done
7.上传数据,验证是否符合BIDS要求,验证链接
参考:
【1】https://www.zhihu.com/column/c_1306280601625337856
【2】https://reproducibility.stanford.edu/bids-tutorial-series-part-2a/
【3】https://nipy.org/workshops/2017-03-boston/lectures/bids-heudiconv/#1
【4】https://www.youtube.com/watch?v=O1kZAuR7E00



