否，Linux和Mac OS X二进制文件不是交叉兼容的。
一方面，Linux可执行文件使用一种称为ELF的格式。
Mac OS X可执行文件使用Mach-O格式。
因此，即使通常在每个系统上分别编译许多库，它们也不会以二进制格式移植。
此外，Linux实际上并非基于UNIX。它确实与UNIX共享许多通用功能和工具，但是其中很多与诸如POSIX之类的计算标准有关。
编辑：
最后，要解决关于字节码的问题：制作二进制文件时，编译器通常会生成特定于您正在开发的平台的机器代码。（并非总是如此，但通常是这样。）
