如何使用awk压缩文件

您需要像这样读取它们的压缩文件：

awk '{ ... }' <(gzip -dc input1.vcf.gz) <(gzip -dc input2.vcf.gz)

尝试这个：

awk 'FNR==NR { sub(/AA=.;/,""); array[$1,$2]=$8; next } ($1,$2) in array { print $0 ";" array[$1,$2] }' <(gzip -dc input1.vcf.gz) <(gzip -dc input2.vcf.gz) | gzip > output.vcf.gz