来自熊猫数据帧的成对矩阵

它只是矩阵乘法：

import pandas as pddf = pd.read_csv('data.csv',index_col=0, delim_whitespace=True)df2 = df.applymap(lambda x: int(not pd.isnull(x)))print df2.T.dot(df2)

输出：

Al01  BBR60  CA07  NL219Al01      4      0     2      3BBR60     0      1     0      0CA07      2      0     3      3NL219     3      0     3      4[4 rows x 4 columns]