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Linux -- 环境配置

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Linux -- 环境配置

安装gaussian

http://sobereva.com/439

  • 将安装包放在 /opt 目录下,进入该目录,解压,命令如下:
tar -xjvf G16-A03-AVX2.tbz
  • 打开用户的 .bashrc文件,写入:
export g16root=/opt
export GAUSS_SCRDIR=/opt/g16/scratch
source /opt/g16/bsd/g16.profile
  • 重启终端

  • /opt/g16/Default.Route里面指定核心数和内存:

-M- 8GB
-P- 6
# 查看核心数
grep processor /proc/cpuinfo |wc -l
# 查看内存(GB,MB)
free -h
free -m
  • 设置权限
cd /opt/g16
chmod 750 -R *
  • 执行命令
cd 
g16 H2O.gjf
  • Questions

ntrex1: Bad file descriptor

解决方法:

  • 查看.gjf文件首行,指定.chk文件路径为当前路径
安装anaconda

https://zhuanlan.zhihu.com/p/349345180

  • 进入安装目录
cd /opt
  • 运行安装包
bash Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh
  • 修改环境变量
    打开用户的.bashrc文件,输入:
    此处未执行重命名的指令
 # 为了避免与其他服务器用户产生命令冲突,使用自己的英文名+Python替代python 
alias python='/opt/anaconda3/bin/python'   
#这里写anaconda的安装路径
export PATH='/opt/anaconda3/bin:$PATH'
  • 变量生效
source ~/.bashrc
创建新用户
sudo useradd deepl
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