软件加密有多种算法，多可文档管理系统采用的是目前加密度最高的AES加密算法，即高级加密标准，又称Rijindael加密法，是目前使用最广的一种加密方式。
使用该种加密，不需要用户额外购置加密设备，因此相比硬件加密方式，更为经济实用。在加密强度上，系统提供了128位、192位和256位三种密钥。密钥越长，意味着加密强度越高，越难以破解，因而也就越安全，但同时服务器的负荷也会更重。因此除非您单位对于文件保密性和安全性要求极高，一般不建议您使用256位密钥。对于普通机关、公司而言，使用128位密钥就可以了。
总体来说，采用软件加密后，系统总体效率会比之前有所降低。但如果您服务器的CPU性能较高、内存和硬盘较大，对系统访问总体上影响并不大。
在多可文档管理系统中，开启加密存储后，用户随后上传的所有文件都会在服务器端由系统自动进行加密，使其变成常人无法阅读的乱码。这样即使文件被黑客或者坏人拷走，他打开文件却无法读懂里面的内容。
下面介绍如何在多可文档中启用加密存储。
1. 在服务管理工具中点击“加密存储”；
2. 弹出的加密存储设置窗口中首页出现的是关于加密的说明，阅读后，请点击“同一，下一步”；
3. 选择“设置新的文件存储加密方案”，并点击下一步；
4. 选择“软件加密”，并点击下一步（如果您的服务器安装了硬件加密卡，想使用硬件加密方法，请在这里选择“硬件加密”，并点击下一步）；
5. 在加密参数设置窗口中，输入密码，并重复输入一次，如果勾选了“显示密码”，是指您在设置密码时可以看到密码，如果不勾选，则只能看到一连串*。然后选择加密强度，按“完成”；
6. 这是会弹出提示框，说明已完成设置，接下来要备份密码。按“完成”；
7. 接下来弹出的是密码文件备份框，这是指将您刚才设置的各项加密参数以文件形式保存下来，您只需在此选定存放该文件的路径，然后按“开始备份”。就像下图中红字说明的那样，请您务必保管好该密码文件，如果该文件丢失，以后就无法进行系统恢复、迁移等操作了；
8. 这时会再次弹出提示，提醒您保管好该密码文件，按“确定”；
9. 弹出提示框，说明系统需重启后才能使加密存储功能生效，按“确定”；
10. 至此，加密存储设置已经完成。在系统自动重启后，会弹出提示框询问是否现在就将服务器里已有文件进行加密。您可以选择“是”，现在就对已有文件加密；也可以选择“否”，以后再对那些文件加密；
11. 如果您选择了“是”，会马上看到“文件加解密”窗口，例如下图中，显示处理文件总数为305，是指服务器上已有文件为305个，点击“开始转换”就可将这些文件进行加密。加密完成后，按“关闭”就可关闭该窗口；
