本次汇报了两篇文章,都是关于利用GNN、CNN获取化合物、蛋白质的特征,再进行相互作用预测。两篇文章的框架已经很熟悉了,输入、输出已经处理方式比较明白,仍有很多不足的地方,接下来进行总结反思:
- 对于模型精度(准确到某个数值)没有准确把握
- 对于各种评估标准不了解
- 以及最后的输出是[0,1]分类还是[0,100]分类没有弄明白
- 论文中提到的“距离”,是谁和谁之间的距离?如何测定?这类基础的定义没有去查(比如残基间距离测定的其实是中心碳原子的距离)
- 两个多星期的时间,一直在扣细节,没有梳理出一个完整的大框架,在最后两天的时间才去整理主体内容,这样太浪费时间
下一步论文学习计划:
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- 每篇论文都要整理出来: 用了什么模型?输入是什么?数据如何处理?输出是什么?模型精度达到了多少?测试集和训练集是什么?和创新点是什么?未来研究方向是什么?



