栏目分类:
子分类:
返回
名师互学网用户登录
快速导航关闭
当前搜索
当前分类
子分类
实用工具
热门搜索
名师互学网 > IT > 前沿技术 > 大数据 > 大数据系统

KEGG数据库以及 KAAS 网站注释

KEGG数据库以及 KAAS 网站注释

1. KEGG

现在自己用到的KEGG数据库主要是功能注释,下面谈一下我再用KEGG 时候的经验吧。
首先在kaas上传数据做基因的注释。
我们用的是prokka注释过后的faa文件:是蛋白序列。
当然基因序列也可以。

kaas 比对网站

https://www.genome.jp/tools/kaas/

得到的结果会在kaas的网站:

上面图片的text文件是下面的内容:

打开html之后内容就是:

代谢通路图(ko):

K号信息:

另外在kobas上可以做kegg富集分析
https://www.jianshu.com/p/1b05500e4983 (可参考这个网站)

总觉得自己写的有很多偏差,心静不下来,就写的很不好。
但是坚持下去吧! 加油。。。

转载请注明:文章转载自 www.mshxw.com
本文地址:https://www.mshxw.com/it/281242.html
我们一直用心在做
关于我们 文章归档 网站地图 联系我们

版权所有 (c)2021-2022 MSHXW.COM

ICP备案号:晋ICP备2021003244-6号