南京市扬子第二小学始建于1986年8月，占地9000平方米，建筑面积6000平方米。
建校以来，曾连续三次被南京市教育局授予"市模范学校"，曾获得"全国功勋集体"、"江苏省红旗大队"等荣誉称号。
2004被评定为"南京市实验小学"，2005年9月率先在区内开展小班化教育实验，现为南京市小班化教育示范学校，2012年被南京市教育局授予"南京青奥示范学校"荣誉称号。
学校秉承生命化教育理念，将"赋能"教育与生命化教育相结合，并在区社会事业局的支持下，全方位推进素质教育，以先进的办学理念，丰富的校本课程，专业的教学管理，贴心的教育行为，优异的教育质量，加强名特优教师培养，完善学校文化建设，努力践行"幸福每一个"的小班精神。
