学分互认就相当于将一定学分的必考课程使用另外的课程进行替代，但其学分自考办仍然承认；课程顶替就是在自考本科过程中，考生是国家承认学历的各类高等学校及自学考试专科以上（含专科）的毕业生及肄业生、退学生，可免考有效期课程名称相同、学分等于或低于原所学课程的课程。
自考的学分互认是什么意思也就是说学分互认就是传统意义上的免考，此课程考试可用其他课程代替，达到了相应学分算是过了，不需要在补考，就比如很典型的：自考英语(二)，由于该课程考试是很多自考专业的选考课，学分高达14分，但是很多人觉得这考试太难，不想考，那么就可以考其他课程来代替自考英语(二)，我们在选考代替课程中，学分加起来要大于等于14分及以上，所以自考英语(二)需用其他三门课(的学分)来代替，反正不能比英语二的学分少。
自学考试中课程顶替的含义所谓“顶替”或“替代”是指在自学考试中，学过井考及格的课程(取得合格证者)，因更换报考(学习)专业或自学考试计划变更，造成相同、相近甚至不同课程的成绩允许相互通用的情况，俗称顶替，如按原考试计划取得“中国革命史”课程合格成绩，2002年以后，在文秘、英语等专科专业可顶替“邓小平理论概况”、“法律基础与思想道德修养”二门课程，而在金融本科则只能顶替“毛泽东思想概况”一门成绩，课程顶替不需要办申请手续，只要依据考试计划，在毕业时将可以顶替的课程合格证上交申办毕业即可。
自考学分互认的操作流程自考学分互认不需要特别的操作，各省自考生在选择自考专业会有一张课程考试表格，只有自考公共课才能作为学分互认课程，根据该表要求满足学分要求，考生可自行选择考试，如果不知道是否满足要求可通过以下三步骤检验：
第一步：登录各省自考官网
第二步：选择需要考试的课程
第三步：进行毕业条件判定，判定后有两种结果：符合和不符合，不符合的情况下可查看是否可做课程顶替，即用其他专业下考试合格的课程来顶替此专业下不合格的课程。课程顶替必须按课程顶替规则来顶替，此专业的课程顶替规则会在课程顶替时展示给考生，考生根据规则和需要来顶替。
