2003年学校在教务处下设研究生办公室，负责研究生管理工作。西藏民族学院研究生处2005年成立，目前设有管理科、培养科和学科建设办公室三个科室，共有工作人员8人。
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研究生处主要职责包括：执行国家研究生招生政策，在学校招生领导小组领导下，开展研究生招生工作;研究生培养的组织协调工作;研究生学位点的建设规划和新学位点的组织申报工作;以及规划学校学科建设等工作。
其他职责包括：研究生普通奖学金、研究生任课教师课时费、研究生导师津贴的审核工作;全校研究生导师的遴选、管理及考核工作等。
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