武汉物理与数学研究所是以核磁共振波谱学、原子与分子物理和数学物理基础研究为主，多学科交叉的研究所。研究所拥有波谱与原子分子物理国家重点实验室、武汉磁共振中心、中科院冷原子物理中心、中科院数学物理联合实验室、中国科学院原子频标重点实验室、中国科学院生物磁共振重点实验室等6个国家级、院级科研平台，同时也是武汉光电国家实验室的组建单位之一。研究所的支撑系统包括：磁共振波谱技术、激光光谱技术、计算机信息中心和高技术工程中心。
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现有无线电物理、分析化学、原子与分子物理、应用数学4个博士学位授权点，无线电物理、原子与分子物理、光学、分析化学、基础数学、应用数学6个硕士学位授权点，电子与通信工程、生物工程2个工程硕士点，以及数学、物理学2个博士后流动站。
研究所注重学科间交叉。除以上学科专业及其交叉的领域外，还覆盖生物、化学、医学、量子信息、电子信息、计算机应用中的新兴方向。
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