国家天文台总部前身——北京天文台成立于1958年，是国务院学位委员会批准的首批学位授予单位之一，是天文学科博士后流动站设站单位。2001年4月，中国科学院成立国家天文台，北京天文台融入国家天文台，成为国家天文台总部。国家天文台由总部及云南天文台、南京天文光学技术研究所、乌鲁木齐天文站和长春人造卫星观测站等单位组成。
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国家天文台总部的主要研究方向是天体物理，包括对太阳、恒星、星系和宇宙学等方面的研究;也有天文技术与方法、天体力学与天体测量、天文学史等方面的研究。国家天文台总部承担的国家重大科学工程“大天区面积多目标光纤光谱天文望远镜”LAMOST项目已经完成，是当今世界上获取天体光谱能力最强大的天文观测设备;现在开始建设的另一国家重大科学工程――世界最大单天线“500米口径球面射电望远镜” FAST项目，开创了建造巨型射电望远镜的新模式;国家天文台目前承担的“嫦娥工程”科学探测任务，研制并集成出了目前我国惟一的可适用于月球探测的多功能于一体技术支撑系统。国家天文台总部与欧美多国以及日本、阿根廷、埃及等国家的大学和研究所等天文机构签订有各类双边合作协议20余项，其中包括联合培养博士研究生以及经常性人员互访活动等;另外每年还举办数次国际性的学术会议。
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