| 南京大学 | 徐州医学院 | 南京电子技术研究所 |
| 苏州大学 | 南京中医药大学 | 南京电子器件研究所 |
| 东南大学 | 中国药科大学 | 中国船舶科学研究中心 |
| 南京航空航天大学 | 南京师范大学 | 江苏自动化研究所 |
| 南京理工大学 | 徐州师范大学 | 江苏省植物研究所 |
| 江苏科技大学 | 南京财经大学 | 江苏省血吸虫病防治研究所 |
| 中国矿业大学 | 南京体育学院 | 中共江苏省委党校 |
| 南京工业大学 | 南京艺术学院 | 南京陆军指挥学院 |
| 常州大学 （原：江苏工业学院） | 苏州科技学院 | 解放军理工大学 |
| 南京邮电大学 | 扬州大学 | 解放军国际关系学院 |
| 河海大学 | 中国科学院紫金山天文台 | 工程兵指挥学院 |
| 江南大学 | 中科院南京地质古生物研究所 | 解放军南京政治学院 |
| 南京林业大学 | 中科院南京地理与湖泊研究所 | 中国人民解放军海军指挥学院 |
| 江苏大学 | 中科院南京土壤研究所 | 中国人民解放军徐州空军学院 |
| 南京信息工程大学 | 中科院南京天文仪器研制中心 | 中国人民解放军总参第五十六研究所 |
| 南京农业大学 | 国网电力科学研究院 | 扬州船用电子仪器研究所 |
| 南通大学 | 南京水利科学研究院 | 南京船舶雷达研究所 |
| 南京医科大学 | 中国航空研究院609研究所 |
注：本列表仅为具有研究生(硕/博)招生权的单位列表，部分单位可能当年不招生，是否招生以及招生专业请以各单位发布专业目录为准。
