为了适应教育改革发展的需要，1998年6月经北京市教委批准，市级重点中学北京十五中高初中分离，初中部分成立北京十五中分校，改制为体制改革试点校，并被宣武区政府、宣武区教育委员会确定为管理体制改革、教育教学改革和教育科研示范校。 北京十五中分校实行董事会领导下的校长负责制（董事长由教委主要负责同志担任）。 北京十五中分校现有31个教学班，学生1527人，教职工118人，专任教师83人。 十五中分校的毕业生均升入高级中学读书，首届毕业生（2001届）85%升入市、区重点高中，第二届毕业生90%升入市、区重点高中就读，其中毕业生的75%升入市重点高中。 十五中分校建校以来，受到同行和新闻媒体的关注，几年来接待过来自全国各地五百多位教育界同行的访问和首都多家新闻媒体的采访、报道。2002年学校被确定为北京市对外开放单位，先后接待过美国、德国、日本、澳大利亚、越南、乌克兰等国教育界人士和政府官员来访。 十五中分校经全体教职工的勤奋工作，被评为宣武区文明单位、宣武区优秀家长学校、《学校体育工作条例》先进校、宣武区绿色学校、宣武区健康促进校、北京市爱国卫生先进单位。
